El Tribunal Supremo avala que Hacienda compruebe saldos de IVA nacidos en períodos prescritos

Resumen Diario Jurídico-Fiscal — 6 de septiembre de 2026. Síntesis ejecutiva de novedades normativas, jurisprudenciales y fiscales en España. Documento que recoge 12 noticias seleccionadas en 5 áreas, publicadas entre el 3 y el 5 de septiembre de 2026.

Normativa y novedades regulatorias

El BOE prorroga treinta días más los controles fronterizos interiores con Italia

Fuente: BOE — Orden INT/932/2026, Ministerio del Interior — 05/09/2026

El Boletín Oficial del Estado publica la prórroga del restablecimiento temporal de los controles en las fronteras interiores aéreas y marítimas respecto de los vuelos y enlaces procedentes de Italia, por razones de seguridad pública. La medida se extiende hasta el 22 de septiembre de 2026 y se somete a evaluación periódica, sin que quepan prórrogas automáticas no motivadas.

Implicación práctica: conviene advertir a clientes con desplazamientos societarios o de negocio entre España e Italia (juntas, cierres de operaciones, firmas notariales) de posibles demoras en los controles hasta el 22 de septiembre.

Consultar la Orden en el BOE

Cambios en la organización y competencias de la Inspección Tributaria y del Área de Aduanas de la AEAT

Fuente: Bou & Associats — Actualidades Fiscales septiembre 2026 — 04/09/2026

Se modifica la estructura y el reparto competencial de la Inspección Tributaria y del Área de Aduanas e Impuestos Especiales de la Agencia Tributaria. El ajuste afecta a la asignación de expedientes y a los órganos competentes para iniciar y resolver actuaciones inspectoras.

Implicación práctica: procede revisar en los expedientes en curso la competencia del órgano actuante. Un cambio de adscripción mal notificado puede fundamentar alegaciones de nulidad o de indefensión.

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Jurisprudencia

El Tribunal Supremo avala que Hacienda compruebe saldos de IVA nacidos en períodos prescritos

Fuente: Allyon ETL — Mini Boletín Fiscal Diario — 04/09/2026

El Alto Tribunal confirma que la Administración tributaria puede comprobar los saldos pendientes de compensación de IVA y los excesos de cuotas soportadas deducibles sobre las devengadas generados en períodos cuyo derecho a liquidar ya ha prescrito, siempre que dichos saldos se apliquen en períodos posteriores no prescritos. La prescripción del período de origen no blinda, por tanto, la magnitud arrastrada.

Implicación práctica: los clientes con saldos de IVA a compensar de larga data deben conservar la documentación soporte más allá del plazo ordinario de prescripción. La carga probatoria sigue recayendo sobre el obligado tributario.

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El Tribunal Supremo prohíbe el «plan B» en las inspecciones: no cabe cambiar de método si falla el elegido

Fuente: Bou & Associats — Actualidades Fiscales septiembre 2026 — 04/09/2026

En el ámbito del Impuesto sobre Sociedades, el Supremo impide que la Inspección sustituya el método de determinación o valoración inicialmente escogido por otro alternativo cuando el primero resulta anulado. La Administración queda vinculada por su propia elección procedimental.

Implicación práctica: abre una vía defensiva de primer orden. Si se logra desmontar el método empleado por la Inspección, la regularización decae sin posibilidad de sustitución por un criterio alternativo.

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El Supremo admite la estimación indirecta cuando se confunden el patrimonio de la sociedad y el del socio

Fuente: Allyon ETL — Mini Boletín Fiscal Diario — 03/09/2026

Cuando una sociedad y uno de sus socios desarrollan la misma actividad y no resulta posible determinar de forma directa qué ingresos y qué gastos corresponden a cada uno, la Administración puede acudir al régimen de estimación indirecta para fijar las bases imponibles. El Tribunal precisa que no es necesario invocar previamente los artículos 13 o 15 de la Ley General Tributaria.

Implicación práctica: refuerza la necesidad de separar de manera nítida la actividad societaria de la personal del socio, con contabilidad, facturación y medios materiales diferenciados, en las estructuras profesionales y familiares.

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Fiscal (AEAT, DGT y TEAC)

La DGT desvincula la deducción del IVA del combustible y las reparaciones del porcentaje aplicado al vehículo

Fuente: DGT — Consulta vinculante V1450-26 — 04/09/2026

La Dirección General de Tributos establece que el porcentaje de deducción reconocido en la adquisición de un automóvil no se traslada de forma automática al combustible, las reparaciones y los demás bienes y servicios vinculados. Cada gasto debe analizarse de manera autónoma atendiendo a su afectación efectiva a la actividad empresarial o profesional.

Implicación práctica: obliga a revisar los criterios de deducción aplicados por clientes con flotas o vehículos de uso mixto y a documentar la afectación real de cada tipo de gasto.

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El TEAC confirma que las ventajas obtenidas a través de sociedades participadas indirectamente tributan como capital mobiliario

Fuente: TEAC — resolución reseñada en el Mini Boletín Fiscal Diario — 04/09/2026

El Tribunal Económico-Administrativo Central concluye que la participación meramente indirecta no impide apreciar la existencia de una utilidad derivada de la condición de socio. Cuando la ventaja económica tiene su causa en el capital invertido por la persona física, procede su calificación como rendimiento del capital mobiliario en el IRPF.

Implicación práctica: afecta de lleno a las estructuras holding familiares. Conviene revisar los flujos de valor entre filiales y personas físicas socias para anticipar el riesgo de regularización.

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Deducibilidad de los gastos financieros en el Impuesto sobre Sociedades y límites a la recalificación de los préstamos participativos

Fuente: Bou & Associats — Actualidades Fiscales septiembre 2026 — 04/09/2026

Se acota el margen de la Administración para recalificar los préstamos participativos como fondos propios y negar, por esa vía, la deducibilidad de los gastos financieros asociados. La calificación mercantil de la figura y su documentación resultan determinantes.

Implicación práctica: relevante para las estructuras de financiación intragrupo y para los vehículos inmobiliarios. Procede reforzar la documentación contractual y el soporte de mercado de los préstamos participativos vigentes.

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El salario del teletrabajador en España para una empresa portuguesa tributa exclusivamente en España

Fuente: DGT — Consulta vinculante V1339-26 — 03/09/2026

La consulta determina que el lugar de prestación física del trabajo fija la potestad tributaria, de modo que la retribución del empleado que teletrabaja desde territorio español queda sujeta únicamente al IRPF español. La empresa portuguesa sin establecimiento permanente no está obligada a practicar retenciones si no opera en España.

Implicación práctica: debe advertirse a los clientes del riesgo colateral de generar un establecimiento permanente por teletrabajo transfronterizo y de la conveniencia de formalizar la política interna de trabajo a distancia.

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M&A y mercantil

La CNMV admite a trámite la OPA voluntaria de Ohmnia Electronics sobre Azkoyen por 244,5 millones de euros

Fuente: Press Digital / PC Bolsa — 04/09/2026

La Comisión Nacional del Mercado de Valores acuerda la admisión a trámite de la oferta pública de adquisición voluntaria formulada por el grupo vasco Ohmnia Electronics, S.L. sobre la totalidad del capital de Azkoyen, S.A., por un importe aproximado de 244,5 millones de euros. La admisión a trámite no equivale a autorización: la operación entra ahora en la fase de análisis del folleto por el supervisor.

Implicación práctica: referencia útil de múltiplos y de calendario regulatorio para clientes industriales que evalúen procesos de venta o de exclusión de cotización en el último trimestre del año.

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Propuesta de reforma para facilitar la liquidación de las sociedades con el NIF revocado

Fuente: Bou & Associats — Actualidades Fiscales septiembre 2026 — 04/09/2026

Se plantea una modificación normativa dirigida a desbloquear la extinción ordenada de las sociedades cuyo número de identificación fiscal ha sido revocado, situación que hoy impide en la práctica otorgar escritura e inscribir la liquidación en el Registro Mercantil. La propuesta busca evitar la proliferación de sociedades zombis.

Implicación práctica: interesa identificar en la cartera de clientes las sociedades inactivas con NIF revocado y preparar su liquidación para acogerse al nuevo cauce cuando se apruebe.

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Inmobiliario

El valor de referencia no puede utilizarse como valor de transmisión en la plusvalía municipal sin comprobación previa

Fuente: Bou & Associats — Actualidades Fiscales septiembre 2026 — 04/09/2026

Se confirma que el ayuntamiento no puede acudir al valor de referencia catastral como valor de transmisión a efectos del Impuesto sobre el Incremento de Valor de los Terrenos de Naturaleza Urbana sin tramitar antes el correspondiente procedimiento de comprobación de valores, con las garantías que le son propias.

Implicación práctica: abre la puerta a impugnar liquidaciones del IIVTNU giradas sobre el valor de referencia y a solicitar la rectificación de autoliquidaciones no prescritas en operaciones inmobiliarias recientes.

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Análisis transversal del día

Prescripción y carga de la prueba. Dos de las resoluciones del período apuntan en la misma dirección: la prescripción del ejercicio de origen no impide comprobar magnitudes que se arrastran a ejercicios vivos. La consecuencia operativa es la ampliación de facto del deber de conservación documental en bases imponibles negativas, deducciones pendientes y saldos de IVA a compensar.

Delimitación entre sociedad y socio. La estimación indirecta por confusión patrimonial y la calificación como rendimiento del capital mobiliario de las utilidades obtenidas mediante participación indirecta refuerzan la línea inspectora sobre las estructuras societarias de profesionales y de grupos familiares. La separación efectiva de medios y de flujos es hoy el primer elemento de defensa.

Límites al margen de actuación de la Inspección. Frente a esa presión, el Supremo introduce un contrapeso relevante al vedar la sustitución del método de regularización cuando el inicialmente escogido resulta anulado. La estrategia procesal debe orientarse a atacar el método antes que el resultado.

Actividad corporativa y financiación. La admisión a trámite de la oferta sobre Azkoyen y la delimitación de la deducibilidad de los gastos financieros en préstamos participativos confirman un entorno de mayor actividad transaccional acompañado de un escrutinio fiscal más fino sobre la estructura de financiación de las operaciones.

Plazos y fechas a vigilar

Fecha Hito
10/09/2026 Fin del plazo de aceptación de la oferta pública de exclusión sobre Ercros
15/09/2026 Publicación por el INE del IRAV correspondiente a agosto de 2026
21/09/2026 Modelos 303, 111, 115 y 123 correspondientes a agosto (grandes empresas y SII)
22/09/2026 Expiración de la prórroga de los controles fronterizos con Italia
30/09/2026 Cierre del tercer trimestre: revisión de saldos de IVA a compensar y de pagos fraccionados

Implicaciones para el despacho

  • Saldos de IVA antiguos: revisar en los clientes con saldos de IVA a compensar de ejercicios antiguos la conservación de facturas y libros registro, ante la confirmación de que la Administración puede comprobarlos aunque el período de origen esté prescrito.
  • Holdings y sociedades profesionales: auditar las estructuras holding familiares y las sociedades profesionales para verificar la separación efectiva entre la actividad de la sociedad y la del socio, así como la trazabilidad de los flujos de valor hacia las personas físicas.
  • Defensa en inspecciones: incorporar a la estrategia en inspecciones de Impuesto sobre Sociedades el ataque directo al método de regularización empleado, dado que su anulación no permite a la Inspección acudir a un criterio alternativo.
  • Plusvalía municipal: identificar las liquidaciones del IIVTNU giradas sobre el valor de referencia catastral en operaciones inmobiliarias no prescritas y valorar su impugnación o la rectificación de las autoliquidaciones presentadas.
  • Financiación intragrupo y sociedades inactivas: reforzar la documentación contractual y el soporte de mercado de los préstamos participativos intragrupo, y revisar el mapa de sociedades inactivas con NIF revocado para anticipar su liquidación ordenada.

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